Обновленные модели получили другой ЦП (одноядерный Intel Atom D425), тактовая частота которого выше на 200 МГц и равна 1,8 ГГц.

Другим важным моментом является внедрение поддержки накопителей емкостью 2 ТБ — таким образом, максимальный объем хранимых данных на четырехдисковом TS-439 Pro II+ может достигать 8 ТБ. Возможна горячая замена жестких дисков и их организация в массивы RAID 0, 1, 5, 6 и JBOD. Объем ОЗУ стандарта DDR3 остался прежним и составляет 1 ГБ. Как и другие новинки сезона, хранилища TS-239 Pro II+ и TS-439 Pro II+ работают под управлением ПО QNAP NAS 3.3, возможна установка дополнительных приложений QPKG посредством веб-интерфейса. Владельцам мобильных аппаратов под управлением iPhone OS и Android пригодится утилита Qmobile, позволяющая удаленно просматривать хранимые данные.